口内炎について適確に対処することは歯科医にとっても簡単なことではありません。口内炎は細菌、真菌、ウイルスなどの感染やその他の感染症以外の薬物、アレルギー、白血病、放射線などによってもおこります。対処する方法がそれぞれ原因により異なる場合もありますが、いずれの場合も口腔を清潔にすることが最も重要です。
その際、清拭に用いる薬剤が冷たいと疼痛を強く与えてしまうため、体温に近い温度に暖ためた刺激の少ない薬剤などを、スポンジブラシなどに含ませて清拭をすることがケアの中心になります。
ただし強酸性水を使用するときには、暖めすぎると（40度以上）塩素が分解して消毒効果が失われてしまいますので、温度には注意が必要です。
頻繁に口内炎が生じる場合は医療処置として対処する必要があります。

＜開口したくない場合＞
拒否行動や過敏反応の場合が多いようです。日常の気管内吸引や口腔内は吸引によって痛みや違和感を強くかんじていることが、原因と考えられます。
口腔ケアや日常の場面で、強い接触痛や違和感を与えないようにするため、ガーゼバイトブロックなどを使います。
＜開口できない場合＞
顎の関節の異常などで開口できない場合には、最小限の開口位で口腔ケアが出来るようくうふしましょう。小さな歯ブラシなどを使用すれば、基本的に１センチ程度の隙間の確保で口腔ケアは可能になります。